Missing coverage evidence...
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TTCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAC  >  minE/404323‑404393 |                                                                       ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGa                                   >  1:1450241/1‑38 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGTTCATCAGTGCCTTAc  >  1:2135239/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTa   >  1:1957725/1‑70 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:298315/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2404822/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2471018/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2536083/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2537110/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2589249/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2622095/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2812397/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2858079/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2890656/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2356059/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:431349/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:468971/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:528378/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:636809/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:754725/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:768851/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:842582/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:847902/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:919077/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:982460/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1007552/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1087306/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1239536/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1249654/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1346875/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1380742/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1406495/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1612490/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1657491/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1659278/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1668872/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1753214/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1754211/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1803729/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:1966080/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2158180/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2316286/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2327059/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAc  >  1:2402201/1‑71 (MQ=255) ttCGGCGGTGCTCATAAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTaa  >  1:2895418/1‑70 (MQ=255) ttCCGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTa   >  1:1055008/1‑70 (MQ=255) |                                                                       TTCGGCGGTGCTCATCAGCAAATGAGGAACCTTCACGATACCGTCATTAATCAGGATCATCAGTGCCTTAC  >  minE/404323‑404393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑