Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 350,530 G→A 100% intergenic (+127/+72) glxR → / ← purK tartronate semialdehyde reductase, NADH‑dependent/N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE350,5300GA100.0% 159.9 / NA 47intergenic (+127/+72)glxR/purKtartronate semialdehyde reductase, NADH‑dependent/N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/47);  total (0/47)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

TGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCG  >  minE/350498‑350568
                                |                                      
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:283278/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2058044/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2060535/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2069805/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2110156/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2302362/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2322801/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2411254/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2523744/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:259198/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:259386/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2749795/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2042886/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:290235/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:425917/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:568325/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:578335/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:67164/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:771921/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:829531/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:872232/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:918922/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:930424/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:940879/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1620091/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1071274/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1135679/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1169642/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1184397/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:122127/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1247441/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1391927/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1416874/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:145269/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1600789/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1604160/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1013303/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:165192/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1665046/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1676872/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1726930/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1815881/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1965787/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1969198/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:1992102/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2021356/71‑1 (MQ=255)
tGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGACCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCg  <  1:2021517/71‑1 (MQ=255)
                                |                                      
TGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGCCGGATAAGGCG  >  minE/350498‑350568

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: