Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	minE	622,731	T→C	100%	H571H (CAT→CAC)	ycaI →	conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	622,731	0	T	C	100.0%	101.7 / NA	28	H571H (CAT→CAC)	ycaI	conserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/28);  total (0/28)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

ATCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCATATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTA  >  minE/622694‑622764                                      |                                  aTCTGTATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1522523/71‑1 (MQ=255) aTCTGGCTCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:607575/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2396916/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:890081/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:754224/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:41631/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:332496/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:300660/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2907611/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:284529/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2586050/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2498049/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2470942/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2441953/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2413266/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:101909/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2335148/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2272992/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:225284/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:172829/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1655926/71‑1 (MQ=255) aTCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1418014/71‑1 (MQ=255)  tCTGGATCACCGGGGAGTGCTGGATTCTATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1407945/70‑1 (MQ=255)  tCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2256691/70‑1 (MQ=255)  tCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:2004214/70‑1 (MQ=255)  tCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1433466/70‑1 (MQ=255)  tCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1348838/70‑1 (MQ=255)               ggAGGGCTGGATTCAATATTGCACATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTa  <  1:1364468/57‑1 (MQ=255)                                      |                                  ATCTGGATCACCGGGGAGGGCTGGATTCAATATTGCATATATGGCCGATGTTATGGATCAGAAGTCCGTTA  >  minE/622694‑622764

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑