Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 1,132,803 G→A 100% intergenic (+119/‑38) arpB → / → yniD ECK1718:JW5278+JW1710:b4494; hypothetical protein/hypothetical protein

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,132,8030GA100.0% 88.1 / NA 27intergenic (+119/‑38)arpB/yniDECK1718:JW5278+JW1710:b4494; hypothetical protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/27);  total (0/27)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

GACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGG  >  minE/1132769‑1132854
                                  |                                                   
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:2016703/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:954902/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:923434/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:619506/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:586327/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:489387/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:2865168/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:2485260/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:2296020/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:2105213/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1109631/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1953719/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1888647/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1845244/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:155499/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1541895/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1498157/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1428859/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1340414/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1224758/71‑1 (MQ=255)
gACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:118010/71‑1 (MQ=255)
 aCGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1803990/70‑1 (MQ=255)
 aCGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGATACACTCCGTTATCACGCACAAgaga                 <  1:1668300/70‑1 (MQ=255)
               aaaaaaTCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTgg  <  1:2428343/71‑1 (MQ=255)
               aaaaaaTCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTgg  <  1:438395/71‑1 (MQ=255)
               aaaaaaTCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTgg  <  1:573651/71‑1 (MQ=255)
               aaaaaaTCCCTTGATGCCTATCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTgg  <  1:620895/71‑1 (MQ=255)
                                  |                                                   
GACGGCTGTAATAACAAAAAATCCCTTGATGCCTGTCCCTTTTGTTACACTCCGTTATCACGCACAAGAGATATGCAGGACACTGG  >  minE/1132769‑1132854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: