Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 1,698,958 A→G 100% I280V (ATT→GTT)  csiE → stationary phase inducible protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,698,9580AG100.0% 267.2 / NA 69I280V (ATT→GTT) csiEstationary phase inducible protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/69);  total (0/69)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

ATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGA  >  minE/1698911‑1698980
                                               |                      
ttaCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2182796/69‑1 (MQ=255)
ataCCCTCCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:902490/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCTGGAaga  <  1:373984/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:412825/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2232420/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2287797/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2325422/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:240966/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2444178/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2476274/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2679975/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2752148/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2814169/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2841448/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2904510/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:296842/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:223698/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:453537/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:521598/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:649608/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:655299/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:689741/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:703462/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:705186/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:713194/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:901297/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:940217/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:960492/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:990381/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:994684/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2104873/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1121795/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1131285/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1138595/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1224348/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1245273/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1293555/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1314960/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1336712/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1386927/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:14367/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1506596/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1561682/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1636594/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1747458/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1782633/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1819812/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2152440/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2095136/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2071438/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2044123/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2023859/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:198634/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1822855/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1817718/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:178782/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATAGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:919091/70‑1 (MQ=255)
ataCCCACATCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1020065/70‑1 (MQ=255)
 taCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1507785/69‑1 (MQ=255)
 taCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2723763/69‑1 (MQ=255)
 taCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:2823716/69‑1 (MQ=255)
 taCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1511691/69‑1 (MQ=255)
 taCCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:383287/69‑1 (MQ=255)
   cccACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:1299312/67‑1 (MQ=255)
         tCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:411287/61‑1 (MQ=255)
              cAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:272577/56‑1 (MQ=255)
               aGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:605351/55‑1 (MQ=255)
                   gTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCCGGAaga  <  1:15908/51‑1 (MQ=255)
                          cGCAGTTTGTTTGCCATCGGTGTTGATAATACCCTGCAGGAaga  <  1:2196345/44‑1 (MQ=37)
                                               |                      
ATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGA  >  minE/1698911‑1698980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: