Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 2,300,132 A→G 100% F647L (TTT→CTT)  metL ← fused aspartokinase II and homoserine dehydrogenase II

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,300,1320AG96.4% 193.7 / ‑2.5 55F647L (TTT→CTT) metLfused aspartokinase II and homoserine dehydrogenase II
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (1/1);  new base G (40/13);  total (41/14)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff.
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

CACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAACGGCACGCTACCGTCGAATTGCAGG  >  minE/2300075‑2300157
                                                         |                         
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGTCACGCTACCg              >  1:2337536/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTAcc               >  1:77894/1‑70 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:553398/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2425415/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2495173/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2652678/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2725709/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2790369/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2801212/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2821133/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:328513/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:380018/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:118730/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:572083/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:57446/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:675167/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:684528/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:735971/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:758786/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:91205/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:91440/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:996443/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2068215/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1816089/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1751700/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1691898/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1900616/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1602533/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1528671/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:195802/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2067312/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2081348/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1363075/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1352936/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:221738/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1317787/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:1308969/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:2293779/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:225103/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAACGGCACGCTACCg              >  1:2640662/1‑71 (MQ=255)
cACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATACACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCg              >  1:749294/1‑71 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCATGCTACCGTCg           <  1:2301069/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:1024521/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:1447925/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:417336/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:355406/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:1934504/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:20503/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:2752877/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:2192824/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:2413630/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:2400289/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:2392153/71‑1 (MQ=255)
   gcgGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGACCCACCAGCTCGGTAAGCGGCACGCTACCGTCg           <  1:433006/71‑1 (MQ=255)
            gTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAACGGCACGCTACCGTCGAATTGCAgg  <  1:2447165/71‑1 (MQ=255)
                                                         |                         
CACGCGGGTCAGGTTCGGTTAAGCCCTGCTGCCACGCCTGATCCACCAGCTCGGTAAACGGCACGCTACCGTCGAATTGCAGG  >  minE/2300075‑2300157

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑