Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	minE	236,898	G→A	100%	E85K (GAA→AAA)	yaiE →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	236,898	0	G	A	89.2%	105.3 / 5.0	37	E85K (GAA→AAA)	yaiE	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (2/2);  new base A (33/0);  total (35/2)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.01e-03
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

GGTGTTTAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTGTAATTCCTCGCCTT  >  minE/236852‑236941                                               |                                            ggTGTTTAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGc                      <  1:2431988/70‑1 (MQ=255) ggTGTTTAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGc                      <  1:46158/70‑1 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCaaa                                           >  1:1521581/1‑43 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCt                 >  1:923052/1‑69 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2897444/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:1237287/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:295695/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:313074/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:314568/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:345244/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:399028/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:435754/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:530520/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:567504/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:653308/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:675111/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:67845/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:706140/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:706737/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:81662/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2788383/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:1399026/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:15043/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:1822912/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:1973775/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2044611/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2098899/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2207000/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2268706/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2270036/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2424517/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2526532/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2544766/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2605287/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTg                >  1:2877350/1‑70 (MQ=255)       tAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCAAACCCACCTCTTATCTGTGCCGATATCTg                >  1:961046/1‑70 (MQ=255)                    cacaGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTGTAATTCCTCGCCtt  >  1:2095987/1‑71 (MQ=255)                    cacaGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTGTAATTCCTCGCCtt  >  1:1232117/1‑71 (MQ=255)                                               |                                            GGTGTTTAATGTTCCCGGTCACAGTGAGTTTCATCTGCAAGTTGCCGAACCCACCTCTTATCTGTGCCGCTATCTGTAATTCCTCGCCTT  >  minE/236852‑236941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑