Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	minE	1,373,535	Δ1 bp	100%	coding (474/1239 nt)	yeiT →	predicted oxidoreductase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,373,535	0	C	.	100.0%	121.1 / NA	27	coding (474/1239 nt)	yeiT	predicted oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base . (27/0);  total (27/0)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

ACGATTTATGAGAAAGAAGCGCACCCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCAA  >  minE/1373512‑1373568                        |                                  aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:424373/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:83889/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:639830/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:590632/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:584728/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:583933/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:583473/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:578419/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:571828/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:553758/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:514683/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:460163/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:459280/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:428401/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:106993/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:389521/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:367892/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:320620/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:313460/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:291163/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:282693/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:254624/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:160968/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:156186/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:147808/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:14454/1‑56 (MQ=255) aCGATTTATGAGAAAGAAGCGCA‑CCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCaa  >  1:11457/1‑56 (MQ=255)                        |                                  ACGATTTATGAGAAAGAAGCGCACCCCGGTGGCTGGTTGCGTAACGGTATTCCGCAA  >  minE/1373512‑1373568

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑