Missing coverage evidence...
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AAGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGACC  >  minE/208687‑208753                                                                   | aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:510249/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:660327/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:622186/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:59136/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:587759/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:586235/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:563685/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:542808/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:535632/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:529530/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:51551/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:122080/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:507875/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:437238/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:413181/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:39029/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:304398/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:229037/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:222860/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:197961/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:17206/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:127714/67‑1 (MQ=255) aaGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:126760/67‑1 (MQ=255)  aGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:38319/66‑1 (MQ=255)  aGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:542978/66‑1 (MQ=255)  aGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGAcc  <  1:55850/66‑1 (MQ=255)                                                                   | AAGGCACAAAATTTACAGCTTGATGCCGAAGATAAAAAAGCGATCGCCGCACTGGATTGCAACGACC  >  minE/208687‑208753

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑