Missing coverage evidence...
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CATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCAAAC  >  minE/2314501‑2314574                                                                       |    cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCTATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:138288/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:415215/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:616361/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:599650/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:59447/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:592575/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:577079/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:55922/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:538425/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:503284/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:499945/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:487303/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:473445/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:430208/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:42804/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:101002/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:393645/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:387180/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:384410/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:378908/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:288899/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:265937/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:249363/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:216544/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:214248/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:16216/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:161910/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:112571/71‑1 (MQ=255) cATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGGGCATTTGCCTACCGCa     <  1:381127/71‑1 (MQ=255)   ttCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:443524/69‑1 (MQ=255)    tCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCAAAc  >  1:285776/1‑71 (MQ=255)                               cccTATCGCTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCa     <  1:52076/41‑1 (MQ=255)                                                                       |    CATTCCTTACTTCCTGGTGCCGCTTTTCGGCCCTATCGTTGGCGCGATTGTAGGTGCATTTGCCTACCGCAAAC  >  minE/2314501‑2314574

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑