Missing coverage evidence...
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CTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTCC  >  minE/2335935‑2336004                                                                      | cTGCCTGAAAGCTTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:632825/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCTATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:323070/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:580952/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:468184/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:482375/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:495528/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:495571/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:51191/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:530563/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:532211/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:548241/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:579580/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:468041/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:587209/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:606735/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:613198/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:617151/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:618673/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:623916/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:65187/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:98849/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:99340/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:30631/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:11992/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:1215/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:129758/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:189304/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:21847/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:243635/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:244269/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:276945/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:29853/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:311698/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:31991/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:325164/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:338698/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:369203/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:432968/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:43901/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:440518/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTcc  >  1:449343/1‑70 (MQ=255) cTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGACGACTTCCAGTcc  >  1:109773/1‑70 (MQ=255)                                                                      | CTGCCTGAAAGCGTGCCCGGCGGAAGGTGCAATTATTCAGTATGCCAACGGTATCGTCGACTTCCAGTCC  >  minE/2335935‑2336004

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑