Missing coverage evidence...
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GCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGA  >  minE/2340320‑2340389                                                                      | gCTTTCACGTAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:191019/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTTCATTGa  <  1:107/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:613402/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:463049/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:474694/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:480932/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:53211/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:540041/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:545635/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:581384/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:584731/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:595634/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:429107/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:622782/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:623325/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:635223/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:645323/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:656114/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:66114/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:70258/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:77832/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:251533/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:113542/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:15752/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:157851/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:160068/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:185247/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:221782/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:240537/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:443314/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:256644/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:256829/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:285633/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:297736/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:319955/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:328679/70‑1 (MQ=255) gCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:334560/70‑1 (MQ=255)  cTTTCACGGAGCATTAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCTCCATCATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:65105/69‑1 (MQ=255)  cTTTCACGGAGCATAAAACGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:279095/69‑1 (MQ=255)                        ttATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:250783/47‑1 (MQ=255)                               aaGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGa  <  1:300949/40‑1 (MQ=255)                                                                      | GCTTTCACGGAGCATAAAAAGGGTTATCCAAAGGTCATTGCACCAACATGGTGCTTAATGTTTCCATTGA  >  minE/2340320‑2340389

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑