Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2343596	2343630	35	41 [0]	[0] 48	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTG  >  minE/2343525‑2343595                                                                       | cgcTGCTCAAGCGGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:226649/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:502551/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:3824/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:385557/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:394514/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:416694/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:442380/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:464406/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:474564/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:378028/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:510619/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:78834/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:52504/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:582882/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:66865/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:6179/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:619602/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:623296/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:196688/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:105130/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:116001/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:119292/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:180139/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:85465/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:186421/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:188330/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:214604/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:251129/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:269046/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:304308/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:318984/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:322489/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCATCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:2728/71‑1 (MQ=255)  gctgctCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCTGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:219580/70‑1 (MQ=255)  gctgctCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:94728/70‑1 (MQ=255)  gctgctCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:655187/70‑1 (MQ=255)  gctgctCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:513980/70‑1 (MQ=255)  gctgctCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:181101/70‑1 (MQ=255)          aGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:607447/62‑1 (MQ=255)                 tAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:604401/55‑1 (MQ=255)                      aGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:106658/50‑1 (MQ=255)                                                                       | CGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTG  >  minE/2343525‑2343595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑