Missing coverage evidence...
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CCATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGTTTT  >  minE/2439821‑2439891                                                                       | ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:183110/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:66456/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:644146/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:636043/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:63567/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:601910/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:5939/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:591937/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:58880/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:577195/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:572382/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:546013/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:512523/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:507293/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:487588/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:486639/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:466811/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:423224/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:375341/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:365218/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:348535/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:340803/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:337295/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:328141/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:264636/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:230310/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:214814/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:197934/1‑71 (MQ=255) ccATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:100033/1‑71 (MQ=255) ccATCAACAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGtttt  >  1:84672/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CCATCATCAGGGTGATGCCGCCCTGTTTCAGTGCTTCGGTGATGGTTTCCCAACCGAACTGAATCAGTTTT  >  minE/2439821‑2439891

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑