Missing coverage evidence...
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CAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGC  >  minE/2445979‑2446049                                                                       | cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCTACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:184191/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:598352/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:504143/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:514482/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:51855/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:521300/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:539357/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:573255/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:588434/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:59504/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:491655/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:604558/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:60910/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:64807/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:68942/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:70427/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:97431/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:126150/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:457661/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:423549/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:419244/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:391909/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:145484/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:344298/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:332919/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:165255/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:304569/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:242108/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:227212/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:215582/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:167363/71‑1 (MQ=255) cAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGAAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:490646/71‑1 (MQ=255)    ccGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:328938/68‑1 (MQ=255)     cGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:547292/67‑1 (MQ=255)          cattGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGc  <  1:650404/60‑1 (MQ=255)                                                                       | CAACCGGTCCTTTGTGCGAGTCGTAGCAACGGATGCCTTCAAAAACCGAAGTGCCATAGTGCAGCGCGTGC  >  minE/2445979‑2446049

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑