Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539742	2539748	7	18 [0]	[0] 3	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

TATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATA  >  minE/2539674‑2539741                                                                    | tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAATGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:525350/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:434438/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:77573/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:71582/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:589957/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:587501/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:559837/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:520859/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:471280/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:144344/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:377027/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:358410/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:291166/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:271218/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:182649/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:169649/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:168192/1‑68 (MQ=255) tataATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTtata  >  1:146701/1‑68 (MQ=255)                                                                    | TATAATGATGGTTTTTTTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATA  >  minE/2539674‑2539741

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑