Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2540450	2540487	38	26 [0]	[0] 15	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

AAATCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATTAT  >  minE/2540379‑2540449                                                                       | aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:138261/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:61772/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:548318/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:546606/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:516453/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:467278/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:455705/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:445061/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:44223/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:426799/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:41312/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:40429/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:404252/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:40193/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:401833/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:39439/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:319198/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:2945/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:215531/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:20519/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:200699/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:187161/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:144174/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:118764/71‑1 (MQ=255) aaaTCAATTAATGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:391468/71‑1 (MQ=255)                        aaGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATtat  <  1:65715/48‑1 (MQ=255)                                                                       | AAATCAATTATTGAATTTAAAAAAAGATATAAACATCTTTTAGTGCAACATCATTATATCTCAGGAATTAT  >  minE/2540379‑2540449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑