Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2626492	2626563	72	66 [0]	[0] 29	rpoH	RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor

CAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGATGTT  >  minE/2626421‑2626491                                                                       | cAAAGTTTAGCTTTAGCCCGAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:2938/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:576825/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:316957/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:39067/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:407904/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:409313/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:41639/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:451682/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:459550/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:495255/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:536408/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:537056/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:572763/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:112226/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:584329/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:592963/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:59297/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:627166/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:629132/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:637719/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:638624/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:652027/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:71051/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:81593/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:91592/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:311116/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:112530/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:117658/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:118729/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:133091/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:14866/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:148829/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:169734/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:170075/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:187252/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:189376/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:193358/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:216484/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:218850/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:22340/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:313832/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:307997/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:270239/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:224089/71‑1 (MQ=255) cAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGCCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:627056/71‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:107190/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:73492/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:403306/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:436278/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:442561/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:450919/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:55236/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:195561/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:456266/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:531080/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:508427/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:507841/70‑1 (MQ=255)  aaaGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:50327/70‑1 (MQ=255)    aGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:115164/68‑1 (MQ=255)                        tGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:284463/48‑1 (MQ=255)                           cAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:553362/45‑1 (MQ=255)                           cAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:266159/45‑1 (MQ=255)                           cAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:465867/45‑1 (MQ=255)                             aCCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGAtgtt  <  1:625838/43‑1 (MQ=255)                               cTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCTAtgtt  <  1:541990/41‑1 (MQ=255)                                   aTTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTTGCCGAtgtt  <  1:324942/37‑1 (MQ=255)                                                                       | CAAAGTTTAGCTTTAGCCCCAGTTGGCAACCTGGATTCCTACATCCGGGCAGCTAACGCGTGGCCGATGTT  >  minE/2626421‑2626491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑