Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2662131	2662143	13	22 [0]	[0] 30	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

ACATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCC  >  minE/2662060‑2662130                                                                       | acttGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:80413/68‑1 (MQ=255) acttGGCGGTATCGCCGCGCAGGGGGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:228257/68‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGcccc  <  1:280637/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:494618/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:604505/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:602783/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:606466/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:621791/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:565365/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:548389/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:53228/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:521995/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:405531/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:403452/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:26581/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:254748/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:157170/71‑1 (MQ=255) aCATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGGGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:96477/71‑1 (MQ=255)  cATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:368533/70‑1 (MQ=255)  cATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:169191/70‑1 (MQ=255)   aTGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:586435/69‑1 (MQ=255)                         tGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGcc  <  1:568583/47‑1 (MQ=255)                                                                       | ACATGGCGGTATCGCCGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCC  >  minE/2662060‑2662130

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑