Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2662504	2662596	93	28 [0]	[0] 8	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

CAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTA  >  minE/2662433‑2662503                                                                       | cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:437711/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:98455/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:77244/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:636689/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:629417/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:62118/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:539144/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:502175/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:493693/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:451927/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:447799/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:444237/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:440735/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:108273/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:434477/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:422141/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:340525/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:324107/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:273249/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:222820/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:207704/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:181494/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:179741/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:126527/71‑1 (MQ=255) cAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:117665/71‑1 (MQ=255)   ggTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:6252/69‑1 (MQ=255)                  ccAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:328020/54‑1 (MQ=255)                      cagAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTa  <  1:137209/50‑1 (MQ=255)                                                                       | CAGGTAACGCGCTTCTGCCAGCAGAAACCAGCAAATCTGCGCGACGTGGGTACCGGTGGTGATGTGAATTA  >  minE/2662433‑2662503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑