Missing coverage evidence...
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GGGATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAC  >  minE/252359‑252429                                                                       | gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGTCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:362577/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:376218/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:657082/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:653543/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:644511/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:580759/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:573509/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:55685/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:542319/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:505031/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:48596/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:479398/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:462958/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:396446/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:161943/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:336465/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:331859/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:2973/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:277827/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:268277/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:265122/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:254034/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:223658/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:214845/71‑1 (MQ=255) gggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:179540/71‑1 (MQ=255)  ggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:42801/70‑1 (MQ=255)  ggATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAc  <  1:332375/70‑1 (MQ=255)                                                                       | GGGATATTGCGCGCCTGCCGCTGGCGGTGGTCTGGCTGTTCACCTGGCCTGGTGTACCGTGCATTTATTAC  >  minE/252359‑252429

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑