Missing coverage evidence...
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TCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTG  >  minE/2876386‑2876456                                                                       | tCAATTCCGCTGTCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:273598/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:520755/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:380929/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:427467/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:446311/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:452756/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:455425/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:464549/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:467781/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:377732/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:602527/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:610470/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:61711/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:632996/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:64493/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:650075/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:78678/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:112403/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:353521/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:346573/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:339114/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:307340/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:269511/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:250055/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:241200/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:197914/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:183382/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:174497/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:163093/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:153921/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:146012/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTCTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTCCTGTCTGGCCTTCCTg  <  1:586292/71‑1 (MQ=255) tCAATTCCGCTATCTGGCTGGAACGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTg  <  1:114804/71‑1 (MQ=255)                                                                       | TCAATTCCGCTATCTGGCTGGAATGGTTGCGTTTGGGTAGTTTGCGGCTGCTCTTCTGGCTGGCCTTCCTG  >  minE/2876386‑2876456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑