Missing coverage evidence...
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TCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGCATCA  >  minE/2939643‑2939699                                                         | tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:464461/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:84105/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:72348/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:621952/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:600630/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:57134/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:565575/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:543212/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:102874/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:322982/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:26131/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:259714/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:225554/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:168920/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:163019/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:154251/57‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACAGGTGATGCTACGcatca  <  1:59246/57‑1 (MQ=255)  cAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:375532/56‑1 (MQ=255)  cAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:400028/56‑1 (MQ=255)    gggCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:153404/54‑1 (MQ=255)      gCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:624528/52‑1 (MQ=255)                       tCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGcatca  <  1:49343/35‑1 (MQ=255)                                                         | TCAGGGCCGAAACAGGCAGCAGTCTGCGGTGACGTCCACCGGTGATGCTACGCATCA  >  minE/2939643‑2939699

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑