Missing coverage evidence...
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GCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACC  >  minE/2958032‑2958102                                                                       | gCGACAAACTGCACGTTCGGGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:99819/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTATGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:630147/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGGCACCGccaccacc  <  1:241898/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:73155/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:600336/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:579017/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:557985/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:536297/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:531939/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:330032/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:517896/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:488741/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:461345/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:459111/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:42177/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:411445/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:391836/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:321572/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:240253/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:148515/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:156645/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:198392/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:205240/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:218959/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:235968/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:2480/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:256969/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:263727/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:270208/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:292070/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:298829/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACAGccaccacc  <  1:144428/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTCACACCGccaccacc  <  1:634307/71‑1 (MQ=255) gCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCGCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:391569/71‑1 (MQ=255)  cGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:56852/70‑1 (MQ=255)                ttCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:319286/56‑1 (MQ=255)                ttCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:236197/56‑1 (MQ=255)                                    tCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGccaccacc  <  1:311306/36‑1 (MQ=255)                                                                       | GCGACAAACTGCACGTTCGCGACGCTAAAGAAGGCTCGGTGAAGGGCTACGCGGGTGACACCGCCACCACC  >  minE/2958032‑2958102

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑