Missing coverage evidence...
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CCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCA  >  minE/2968267‑2968337                                                                       | ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:375579/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:72721/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:645903/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:641880/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:62718/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:614283/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:559487/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:517368/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:499017/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:490747/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:469533/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:437293/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:432040/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:399810/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:101074/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:319947/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:187713/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:109760/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:127886/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:137177/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:138596/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:167086/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:169190/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:290704/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:199103/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:200652/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:212924/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:260330/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:267937/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:27171/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:279838/71‑1 (MQ=255) ccGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAACCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:639752/71‑1 (MQ=255)                 aTTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:585823/55‑1 (MQ=255)                    cGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCa  <  1:516531/52‑1 (MQ=255)                                                                       | CCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCA  >  minE/2968267‑2968337

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑