Missing coverage evidence...
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AATAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCT  >  minE/2968713‑2968783                                                                       | aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:627796/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:475927/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:506829/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:530292/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:530972/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:585198/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:592641/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:601979/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:622337/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:181472/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:63020/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:64095/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:646635/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:648971/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:83043/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:85353/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:85635/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:471196/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:241736/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:458658/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:292651/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:42474/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:304330/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:382810/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:358061/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:357278/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:309942/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:339395/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:336926/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGGGACCTGCt  <  1:534877/71‑1 (MQ=255) aaTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGGCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:632646/71‑1 (MQ=255)  aTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:470006/70‑1 (MQ=255)  aTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:35043/70‑1 (MQ=255)  aTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:507130/70‑1 (MQ=255)  aTAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:503917/70‑1 (MQ=255)   tAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:252958/69‑1 (MQ=255)               ggTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:387978/57‑1 (MQ=255)                gTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCt  <  1:102086/56‑1 (MQ=255)                                                                       | AATAAACATGTGTTGGTGAAATTCACCGTACCACAGCAAACCGCGGTCAGCCAACGTTGGGGTGACCTGCT  >  minE/2968713‑2968783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑