Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2978603	2978843	241	30 [0]	[0] 4	slt	lytic murein transglycosylase, soluble

AGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTGG  >  minE/2978533‑2978602                                                                      | aGGATAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:293589/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:397889/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:81660/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:595379/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:541574/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:531995/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:521037/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:498931/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:475990/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:46818/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:46550/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:459119/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:447486/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:434640/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:407999/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:407244/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:11454/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:366482/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:333798/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:320713/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:31176/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:245514/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:19755/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:184965/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:146397/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:138691/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:123410/70‑1 (MQ=255) aGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:121345/70‑1 (MQ=255)          ccTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:183438/61‑1 (MQ=255)                        gTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTgg  <  1:312734/47‑1 (MQ=255)                                                                      | AGGAGAGCGCCTGGAATCCGAAAGTGAAATCACCGGTAGGGGCCAGCGGCTTGATGCAGATTATGCCTGG  >  minE/2978533‑2978602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑