Missing coverage evidence...
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CACGTCCACGTACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTG  >  minE/289349‑289403                                                       | cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:339066/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:628686/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:625065/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:621848/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:583962/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:579340/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:538662/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:476121/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:432325/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:345666/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:34091/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:103465/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:311707/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:304744/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:294092/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:286643/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:265746/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:201282/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:185542/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:177353/1‑55 (MQ=255) cacgtccacgtACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTg  >  1:154863/1‑55 (MQ=255)                                                       | CACGTCCACGTACCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTG  >  minE/289349‑289403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑