Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 309245 309249 5 41 [0] [0] 14 ybaJ/acrB hypothetical protein/multidrug efflux system protein

TCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTG  >  minE/309173‑309244
                                                                       |
tCCATAACGCGTCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:304021/71‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:56295/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:416117/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:438412/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:445378/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:466346/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:469385/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:50732/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:516432/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:54870/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:414685/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:616459/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:623888/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:625477/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:646789/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:649325/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:652653/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:653228/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:75959/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:9315/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:27345/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:11771/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:12181/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:139277/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:176844/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:217350/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:217519/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:234189/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:114439/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:308743/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:314266/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:316971/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:371627/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:394555/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:394899/70‑1 (MQ=255)
  cATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:413766/70‑1 (MQ=255)
   aTAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:269311/69‑1 (MQ=255)
   aTAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:389580/69‑1 (MQ=255)
   aTAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:138215/69‑1 (MQ=255)
                ttcttAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:475794/56‑1 (MQ=255)
                                     gACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTg  <  1:75369/35‑1 (MQ=255)
                                                                       |
TCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTG  >  minE/309173‑309244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: