Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	313053	313069	17	50 [0]	[0] 11	acrA	multidrug efflux system

AGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACT  >  minE/312982‑313052                                                                       | aGGACGCTCTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:520719/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCTGCCACt  <  1:91284/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:36248/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:375510/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:374226/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:38206/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:406479/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:419/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:426781/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:439742/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:474840/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:497669/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:499095/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:507087/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:514334/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:597573/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:601510/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:619669/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:636414/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:640088/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:645476/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:71344/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:7790/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:252579/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:148123/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:168485/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:175304/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:181311/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:185695/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:20964/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:227561/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:240478/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:24251/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:243767/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:244673/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:357112/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:254823/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:25617/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:261143/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:264136/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:277245/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:335592/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:353263/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGACACCAGCCACt  <  1:40463/71‑1 (MQ=255) aGGACGCACTTTCTGCAGACCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:472919/71‑1 (MQ=255)  ggACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:5037/70‑1 (MQ=255)  ggACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:108548/70‑1 (MQ=255)           ttCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:159914/61‑1 (MQ=255)                  gCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACt  <  1:271230/54‑1 (MQ=255)                      aCTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTCCTGTCACCAGCCACt  <  1:429896/50‑1 (MQ=255)                                                                       | AGGACGCACTTTCTGCAGCCCACTTATTACTACGCGATCGCCTGCTTTCAGACCTTCTGTCACCAGCCACT  >  minE/312982‑313052

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑