Missing coverage evidence...
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TAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGA  >  minE/345596‑345664                                                                     | tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:405166/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:615906/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:598809/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:582989/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:576072/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:533988/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:492105/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:432403/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:420225/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:11849/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:372245/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:259215/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:197702/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:173378/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:129201/69‑1 (MQ=255) tAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:126970/69‑1 (MQ=255)  aaTTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:302512/68‑1 (MQ=255)                                   cTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGa  <  1:139343/35‑1 (MQ=255)                                                                     | TAATTCCGACGGTCGATTCAGCAAAAACGGTTGGCTTAGTGAGTTTACCAGGAATGATGTCCGGGCTGA  >  minE/345596‑345664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑