Missing coverage evidence...
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ATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGG  >  minE/351440‑351510                                                                       | ataatCGGGAAGACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:330815/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:133904/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:99005/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:7482/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:72532/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:661269/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:641755/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:638606/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:505362/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:464453/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:445701/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:44550/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:435613/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:390472/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:376642/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:358933/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:343020/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:324395/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:308088/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:281671/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:274869/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:268020/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:254884/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:208522/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:172541/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:162939/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:122870/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCCGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:361163/1‑71 (MQ=255) ataatCGGGAACACATAGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCgg  >  1:466330/1‑71 (MQ=255)                                                                       | ATAATCGGGAACACATCGCGGTTCACAAAGGCCGGATGGCGCGCCAGCTCGCGGGTTAATGCGGTTTCCGG  >  minE/351440‑351510

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑