Missing coverage evidence...
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TTAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCGG  >  minE/402386‑402456                                                                       | ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGTCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:547390/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:597046/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:466571/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:469334/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:507810/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:510701/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:512712/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:513260/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:557830/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:561734/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:445389/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:602721/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:616103/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:651449/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:658726/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:67249/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:84419/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:86736/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:90448/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:92901/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:111768/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:386142/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:363951/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:360400/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:358771/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:352271/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:328598/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:307344/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:117293/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:274585/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:231460/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:122884/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:19701/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:188981/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGAGCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:426832/71‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGAGCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:112309/71‑1 (MQ=255)          ttAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:57851/62‑1 (MQ=255)                    tGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:113197/52‑1 (MQ=255)                     ggCGTAGCTGGGGAGCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:118071/51‑1 (MQ=255)                                   tCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCgg  <  1:213801/37‑1 (MQ=255)                                     ggAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCTGCTGTGTCgg  <  1:333345/35‑1 (MQ=255)                                                                       | TTAGCCAGGTTAGTGATTCTGGCGTAGCTGGGGATCGGAAGCGTTGGATGGGCTGCCGTCAGCTGTGTCGG  >  minE/402386‑402456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑