Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	479018	479214	197	33 [0]	[0] 5	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

GCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTG  >  minE/478949‑479017                                                                     | gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:364004/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:81982/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:80339/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:623002/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:618723/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:559512/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:557645/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:553490/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:518478/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:502463/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:492285/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:492184/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:42035/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:413737/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:40964/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:365678/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:239895/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:136076/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:180524/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:186356/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:20892/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:224175/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:228815/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:235542/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:100535/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:241069/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:279062/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:296065/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:314191/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:316898/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:32587/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:333775/1‑69 (MQ=255) gCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGATCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTg  >  1:54207/1‑69 (MQ=255)                                                                     | GCATGAAGAAAGACCTCGGTTACGGTCTGCTGCTGAAACGCTATACGCCAAACGTGGCTGATGCGACTG  >  minE/478949‑479017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑