Missing coverage evidence...
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GACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTCC  >  minE/480756‑480826                                                                       | gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:139141/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:9597/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:8605/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:86041/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:72338/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:71628/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:661187/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:625859/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:613963/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:580473/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:470244/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:460948/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:396768/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:376601/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:346321/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:343139/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:192815/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:177929/71‑1 (MQ=255) gaCATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:115750/71‑1 (MQ=255)          tgaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:493834/62‑1 (MQ=255)          tgaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:51122/62‑1 (MQ=255)           gaGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:627266/61‑1 (MQ=255)            aGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:368225/60‑1 (MQ=255)                aGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:547222/56‑1 (MQ=255)                    tATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:317890/52‑1 (MQ=255)                     aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:404586/51‑1 (MQ=255)                     aTCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTcc  <  1:552370/51‑1 (MQ=255)                                                                       | GACATCTGATGAGTAAGATTATCGCGACTTTGTATGCGGTAATGGACAAGCGCCCCCTGCGGGCGCTTTCC  >  minE/480756‑480826

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑