Missing coverage evidence...
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GGATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAATTGGCGGGGA  >  minE/527732‑527812                                                                      |            ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATTTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:240606/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGGCGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:115631/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACTAAATAAGCTCCTTGa             <  1:442470/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:58525/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:87517/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:463586/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:468739/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:507378/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:517949/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:522155/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:524033/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:541526/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:560515/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:72527/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:59073/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:597943/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:617345/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:113612/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:622965/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:638107/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:641739/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:70325/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:319136/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:177887/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:181803/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:183041/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:194958/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:227613/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:235672/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:257982/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:279788/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:435291/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:331926/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:333486/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:342957/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:355858/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:365512/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:397707/70‑1 (MQ=255) ggATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:404254/70‑1 (MQ=255)           ttGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAATTGGCGGGGa  <  1:274955/71‑1 (MQ=255)                         tgtTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGa             <  1:331679/46‑1 (MQ=255)                                                                      |            GGATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAATTGGCGGGGA  >  minE/527732‑527812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑