Missing coverage evidence...
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ACGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAC  >  minE/554167‑554236                                                                      | aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:545893/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:100740/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:397082/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:414991/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:429282/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:468579/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:51414/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:526535/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:540612/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:392028/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:558168/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:572747/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:597385/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:605867/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:63322/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:639046/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:647849/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:99470/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:255469/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:107933/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:108654/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:134619/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:149801/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:217702/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:220104/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:387188/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:27822/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:283847/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:34242/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:350760/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:35168/70‑1 (MQ=255) aCGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:373011/70‑1 (MQ=255)    ccGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:345760/67‑1 (MQ=255)      gTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:529795/65‑1 (MQ=255)                ccGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:18096/55‑1 (MQ=255)                   gggTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAc  <  1:162316/52‑1 (MQ=255)                                                                      | ACGCCGTCAGATGCTCCGGGGTTAACTTTTCCCGATGAATAAGCAAACCATTCAGCGCGCGCTCAATCAC  >  minE/554167‑554236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑