Missing coverage evidence...
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CTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATGG  >  minE/556954‑557024                                                                       | cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCTTAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:344475/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:440841/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:80103/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:7767/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:659384/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:659014/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:655637/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:631748/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:564944/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:56158/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:522213/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:516361/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:482523/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:469970/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:114080/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:431299/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:422083/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:376194/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:267748/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:260269/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:238523/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:20961/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:198502/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:180411/71‑1 (MQ=255) cTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:149090/71‑1 (MQ=255)                                cATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATgg  <  1:209050/40‑1 (MQ=255)                                                                       | CTTCGCAGCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCATGG  >  minE/556954‑557024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑