Missing coverage evidence...
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GTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTCAAGATAACTATACCGGTTAAC  >  minE/35293‑35400                                                                       |                                      gTCGAGATGTATTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:601460/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:385002/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:97615/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:95648/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:651184/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:648484/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:645807/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:612639/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:611410/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:596709/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:590557/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:526086/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:403858/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:112900/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:342123/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:321385/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:308807/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:28394/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:277763/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:262437/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:228925/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:195998/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:15788/1‑71 (MQ=255) gTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTaa                                       >  1:126418/1‑71 (MQ=255)                                      cccAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTCAAGATAACTATACCGGTTAAc  <  1:136830/71‑1 (MQ=255)                                                                       |                                      GTCGAGATGTAGTGCAACCTTGTCGCCTTTGCGAATCCCCAGCGTATAAAACAGGTTTGCCGTGCGGTTAATCTCCTGATTTAACTCAAGATAACTATACCGGTTAAC  >  minE/35293‑35400

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑