Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 696683 696915 233 47 [0] [0] 50 appB cytochrome bd‑II oxidase, subunit II

CGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTG  >  minE/696612‑696682
                                                                      |
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATTGCTTTg  <  1:1741/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:565541/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:439869/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:450136/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:451565/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:478269/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:484100/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:526805/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:533431/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:538362/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:541319/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:565256/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:105806/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:567313/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:610868/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:638714/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:646468/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:6489/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:659501/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:71053/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:89046/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:412826/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:133317/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:149320/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:168675/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:18024/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:191065/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:197495/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:205521/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:208050/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:250127/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:252619/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:305258/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:311240/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:320423/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:375311/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:404611/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:413517/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATCGCTTTg  <  1:85895/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCGGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:102543/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTACTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:622045/71‑1 (MQ=255)
cgcTGCACTGTTGGTGAAGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:538582/71‑1 (MQ=255)
 gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:624791/70‑1 (MQ=255)
 gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:32911/70‑1 (MQ=255)
 gcTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:442599/70‑1 (MQ=255)
                aTGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:568305/55‑1 (MQ=255)
                                    gggTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTg  <  1:214607/35‑1 (MQ=255)
                                                                      |
CGCTGCACTGTTGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTG  >  minE/696612‑696682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: