Missing coverage evidence...
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CAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTAAA  >  minE/698417‑698487                                                                       | cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:3711/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:65078/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:644456/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:611431/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:597427/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:581369/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:548579/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:530141/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:492126/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:465660/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:464887/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:401607/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:381622/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:117457/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:341187/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:33800/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:313768/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:296330/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:122645/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:147780/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:242283/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:175565/71‑1 (MQ=255) cAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:151309/71‑1 (MQ=255)  aGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:629270/70‑1 (MQ=255)                     ggTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:581524/51‑1 (MQ=255)                       tCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:365530/49‑1 (MQ=255)                       gcTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:342903/48‑1 (MQ=255)                         ttCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTaaa  <  1:147880/47‑1 (MQ=255)                           ccAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCTCTGTCATTaaa  <  1:285401/45‑1 (MQ=255)                              gACTTTACAGAAGATGCGTTATAAAACGCAGCTGTCATTaaa  <  1:289932/42‑1 (MQ=37)                               aCTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCTCTGTCATTaaa  <  1:532275/41‑1 (MQ=255)                                                                       | CAGTGGATTCAGGTTTCGCTGGTCTTCCAGACTTTACAGCAGATGCGTGATAAAACGCCGCTGTCATTAAA  >  minE/698417‑698487

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑