Missing coverage evidence...
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CGCGTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGAA  >  minE/46647‑46717                                                                       | cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:124662/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:91814/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:90905/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:619358/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:506647/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:4938/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:465747/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:456420/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:442984/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:342172/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:264963/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:253475/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:203419/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:194803/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:108627/71‑1 (MQ=255) cgcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTCTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:601418/71‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:314578/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:287522/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:3450/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:371154/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:382323/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:239754/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:570728/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:136191/70‑1 (MQ=255)  gcgTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGaa  <  1:135358/70‑1 (MQ=255)                                                                       | CGCGTGATTATCGCCGGATTCGGTCGTTTTGGGCAGATTACCGGACGTTTACTGCTCTCCAGCGGGGTGAA  >  minE/46647‑46717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑