Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	795573	795640	68	53 [0]	[0] 33	emtA	lytic murein endotransglycosylase E

ATGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAT  >  minE/795502‑795572                                                                       | aTGCAGTGGCTGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:443774/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGTTCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:386252/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:559584/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:411108/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:416732/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:439790/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:512397/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:51407/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:528168/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:536005/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:539943/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:540511/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:5463/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:399359/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:6031/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:609476/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:611575/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:621862/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:623918/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:628576/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:629809/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:74103/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:89027/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:89353/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:96400/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:232654/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:117447/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:119908/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:128936/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:146691/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:173679/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:184054/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:109974/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:388578/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:205567/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:109096/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:242779/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:252762/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:262761/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:274473/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:287655/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:308036/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:340169/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:366646/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:382389/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:10867/71‑1 (MQ=255) aTGCAGTGGATGCCAATAAGCCAAAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:571913/71‑1 (MQ=255)  tGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:570169/70‑1 (MQ=255)  tGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:110539/70‑1 (MQ=255)  tGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:210790/70‑1 (MQ=255)                             ccGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:100928/43‑1 (MQ=255)                                gTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:75262/40‑1 (MQ=255)                                 tGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAt  <  1:193230/39‑1 (MQ=255)                                                                       | ATGCAGTGGATGCCAATAAGCCAGAAAGCCGGTGCAGCCTGGGGCGTCGATCCACAATTGATCACGGCGAT  >  minE/795502‑795572

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑