Missing coverage evidence...
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TCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACC  >  minE/1005258‑1005328                                                                       | tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:361318/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:87157/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:78029/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:6759/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:632434/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:611588/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:570576/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:535460/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:53254/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:525291/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:443161/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:425556/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:389355/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:371053/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:115931/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:329523/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:321298/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:303298/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:29520/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:241945/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:221672/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:219043/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:211753/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:202017/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:155561/71‑1 (MQ=255) tCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:151594/71‑1 (MQ=255)                      cAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCAcc  <  1:338408/50‑1 (MQ=255)                                                                       | TCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACC  >  minE/1005258‑1005328

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑