Missing coverage evidence...
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TATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTT  >  minE/1022517‑1022586                                                                      | tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:42026/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:79453/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:65588/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:635050/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:60874/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:594851/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:589347/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:558206/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:520731/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:518894/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:518837/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:514470/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:479590/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:465247/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:465128/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:126721/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:394163/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:392621/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:386419/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:383640/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:357660/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:317016/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:292989/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:287390/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:281464/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:241508/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:205440/70‑1 (MQ=255) tATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:151607/70‑1 (MQ=255) tATCCGGATCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:166118/70‑1 (MQ=255)  aTCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:530260/69‑1 (MQ=255)                                 acGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCttt  <  1:267657/38‑1 (MQ=255)                                                                      | TATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTT  >  minE/1022517‑1022586

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑