Missing coverage evidence...
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CGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGT  >  minE/1071878‑1071948                                                                       | cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:386255/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:634639/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:614817/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:570990/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:564510/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:545745/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:543119/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:459764/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:117008/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:383327/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:371864/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:353977/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:292941/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:283323/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:250245/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:204614/71‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:173905/71‑1 (MQ=255)                     tttGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGt  <  1:51322/51‑1 (MQ=255)                                                                       | CGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGT  >  minE/1071878‑1071948

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑