Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1073377	1073465	89	40 [0]	[0] 6	ydhQ	conserved hypothetical protein

ATTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTCC  >  minE/1073306‑1073376                                                                       | aatGCTGGCTTCCCCACCTCGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTCAGGTTGAcc  <  1:146448/69‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:579662/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:404063/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:102387/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:428851/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:457490/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:471469/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:502917/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:521831/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:54911/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:572373/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:404548/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:584932/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:619970/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:620720/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:62798/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:80304/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:9569/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:9767/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:381365/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:105261/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:106603/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:109095/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:124741/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:131787/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:135822/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:153561/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:170812/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:188990/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:215254/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:264768/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:321052/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:339397/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:341121/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:349837/71‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:384259/71‑1 (MQ=255)  ttGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:487629/70‑1 (MQ=255)    gCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:558173/68‑1 (MQ=255)                    ggATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:550500/52‑1 (MQ=255)                              acaaTTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTcc  <  1:453923/42‑1 (MQ=255)                                                                       | ATTGCTGGCTTCCCCACCTGGATACACCAACAATTCACCACCTTCATCTACCACGACCGCTGAGGTTGTCC  >  minE/1073306‑1073376

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑