Missing coverage evidence...
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ACAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCAA  >  minE/1086829‑1086899                                                                       | aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:579879/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:405709/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:46578/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:472297/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:472368/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:522861/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:533147/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:536266/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:542610/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:563645/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:565101/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:391991/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:612151/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:618256/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:62410/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:625980/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:637782/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:648352/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:649915/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:657804/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:68411/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:93246/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:21365/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:11326/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:121680/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:128239/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:138637/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:149773/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:150079/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:173131/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:180076/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:183051/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:104926/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:214545/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:280293/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:307368/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:310024/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:320198/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:330819/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:34774/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:368049/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCaa  >  1:373425/1‑71 (MQ=255) aCAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGG‑CCAGCTCaa  >  1:136014/1‑70 (MQ=255)                                                                       | ACAGCCCTGAATGCTATTTTGTGGACTTCTGTCTTCGTCGCGTAATTCTGGCAGACGCTGGCCCAGCTCAA  >  minE/1086829‑1086899

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑