Missing coverage evidence...
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ATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAT  >  minE/1139103‑1139173                                                                       | atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCTCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:537664/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:544250/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:431286/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:431745/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:439206/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:446152/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:449503/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:463657/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:471353/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:514977/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:542290/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:42443/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:556395/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:56090/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:572733/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:574447/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:636749/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:652161/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:70398/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:76471/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:81180/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:90645/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:284365/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:124484/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:126663/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:145029/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:156391/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:16749/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:175539/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:198571/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:204291/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:215512/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:227828/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:122901/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:301649/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:312572/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:331565/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:33363/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:346116/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:362661/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:401910/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:41093/1‑71 (MQ=255) atctgaGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAt  >  1:413209/1‑71 (MQ=255)                                                                       | ATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCGAAAAACCCGTTTGCCGATCTTACCGGAGCCAAT  >  minE/1139103‑1139173

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑