Missing coverage evidence...
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GCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCA  >  minE/1144612‑1144681                                                                      | gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:103960/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:86455/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:569825/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:53005/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:5265/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:489706/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:486309/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:463775/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:455325/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:449176/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:433321/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:421005/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:394571/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:370460/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:362905/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:35437/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:325158/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:102300/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:107656/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:164647/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:171568/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:180028/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:184012/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:188817/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:210437/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:222262/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:23248/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:271155/70‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:330064/70‑1 (MQ=255)   tGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:116471/68‑1 (MQ=255)     tCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:67091/66‑1 (MQ=255)              tACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:86876/57‑1 (MQ=255)                                    cATCCCTATGCCCAGACTCGGTTCATCACGACTCa  <  1:294359/35‑1 (MQ=255)                                                                      | GCTGTCAGTGGCTTACCCATAGTAAGGACAAAGTGCATCCCTATGGCCAGACTCGGTTCATCACGACTCA  >  minE/1144612‑1144681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑